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中医和西医只有两个区别，一个是对人与自然关系的认识，一个是对整体与局部关系的认识。西医观察不到这些关系，就不承认这些关系的存在，它观察到的只有细胞病变与疾病之间的某种对应性，于是就机械地定义局部细胞病变为病。观察到了细胞病变，那就是有病，观察不到细胞病变，那就是没病。而中医呢？则是建立对这些关系的认识之上，认识到了人与自然的关系，就得出了人顺应自然则生，违背自然则死，疾病就是人与自然矛盾激化的产物；认识到了整体与局部的关系，就得出了细胞是依赖整体的组织液而活着的，它们之所以病变，根本不是细胞的原因，而是不平衡引起的整体管理失控造成的。
由此可见，中医学的疾病是一个从量变到质变的过程，细胞病变是病，而细胞病变之前的量变过程也是病，疾病在中医学里就是一个相对的概念。显然，就对疾病的认识，中医就远高西医一头，细胞发生了质变，疾病的程度就严重了，治疗的难度和成本就高了，可西医只有产生了质变才能够发现。而中医呢，在疾病的量变过程阶段就能够通过中医诊断方法获得，这能够帮助病人提前预防，把疾病消灭在萌芽阶段，治疗的成本就低多了，而且简单易行。
西医以细胞病变为病，而要检查人体内的细胞，不仅需要精密仪器，比如CT，B超，而且有时还需要从人体内部取样，这对人体都有一定的伤害。而中医根据整体决定局部，局部是整体的一个缩影的原理，通过以外揣内的方法来诊断，不仅可以诊断出细胞病变之前的量变程度，而且几乎没有成本，这比西医需要高成本的精密仪器也要高明一畴。
中药和西药治病原理有着根本的不同，西药是用来杀死病变细胞的，而中药是用来疏堵经络的。这是因为西医以为杀死了病变细胞，疾病就好了；而中医疾病则有两大类，一类是细胞的功能亢进引起的，一类是细胞的功能低下引起的，它们的治疗方法完全相反，对于细胞的功能亢进，就要堵塞细胞的营养通道，缺乏了营养，自然就不亢进了，对于细胞的功能低下，就要疏通细胞的营养通道，得到了更多的营养，功能自然增强。这就是中医的扶正法与祛邪法。由于中药是生物大分子，它很难进入细胞膜，因此，对细胞没有质的伤害，恢复起来容易得多，更重要的是，它还可以让病变细胞在整体力量的控制下改邪归正，恢复原有的功能。而西药是化学小分子，它们可以进入细胞膜对病变细胞进行杀伤，一旦杀死了，人体这些组织就废了，再也没有原来的功能了。就这一点来说，中药治病的原理更符合自然之道，西药就应该淘汰了。